Протокол комиссии: как отвечать на требования налоговой
После встречи налоговая составляет протокол, в котором фиксирует:

• Причину вызова
• Участников со стороны ФНС и компании
• Рекомендации подать уточненные декларации по НДС
• Срок на это — обычно две недели

Часто в протоколе прописывают угрозу: если не подадите уточненку, включим вас в план выездной проверки.
Типичная ситуация
Вас вызвали на комиссию и сообщили, что:

• Ваш контрагент похож на фирму-однодневку
• Партнеры второго или третьего звена не уплатили НДС в бюджет

Налоговая требует срочно подать уточненки и доплатить налог. Угрожает выездной проверкой.
Что делать?
Оцените ситуацию
Решение зависит от того, как вы сами оцениваете сделку. Задайте себе вопросы:
Я уверен в контрагенте? Надежная компания с реальной деятельностью или она выглядит сомнительно?
Деюро сделка реальная? У вас есть полный комплект документов: договор, акты, накладные, платежки?
Вы проявили осмотрительность? Проверили партнера перед сделкой, запросили документы, имеете деловую переписку?
Если на все вопросы ответ «да» — не спешите платить. У вас есть все основания отстаивать вычеты.
Как ответить на протокол
Подготовьте письменные возражения. В них укажите:
1. Налоговая не доказала нереальность сделки
Факт, что контрагент не платил налоги или у него нет офиса, не означает, что сделка фиктивная. Это лишь предположение.
2. Нет доказательств вашего сговора
Налоговая должна доказать, что вы знали о проблемах партнера и намеренно работали с ним ради ухода от налогов.
3. Вы проявили осмотрительность
Приложите доказательства:

• Проверили контрагента на сайте ФНС (регистрация, директор не дисквалифицирован, адрес не массовый)
• Запросили документы (устав, выписку из ЕГРЮЛ)
• Оценили деловую репутацию

4. Сошлитесь на статью 54.1 НК РФ
Налоговая вправе отказать в вычете НДС только при одном из условий:

• Сделка нереальна
• Сделка притворна (прикрывает операцию с третьим лицом)
• Вы знали о нарушениях контрагента и извлекали выгоду
• Вы не проверили партнера перед сделкой

Если ни одно из этих условий не доказано — претензии необоснованны.
5. Используйте письмо ФНС от 10.03.2021 № БВ-4-7/3060
В нем разъяснено, как применять статью 54.1 НК РФ. Покажите, что соблюдаете все требования.
Если претензии к контрагентам третьего звена
Не идите на поводу. Закон не обязывает вас отвечать за всю цепочку поставщиков.
Конституционный Суд РФ неоднократно указывал: вы не обязаны контролировать, платят ли налоги компании, с которыми ваш партнер работает сам.
Судебная практика на вашей стороне:

• Определение ВС РФ от 14.05.2020 № 307-ЭС19-27597 (дело «Звездочка»)
• Определение ВС РФ от 28.05.2020 № 305-ЭС19-16064 (дело «Красцветмет»)

Верховный Суд указал: отказ в вычете НДС возможен, только если вы намеренно участвовали в схеме ухода от налогов или знали о нарушениях контрагента.
Пример ответа на протокол
Общество с ограниченной ответственностью «Ромашка»
В ИФНС России № ___ по городу ___
Ответ на протокол рабочей комиссии № ___ от ___
Сообщаем следующее.
Наши контрагенты — ООО «ОДИН» (ИНН ___) и ООО «ДВА» (ИНН ___) — отразили реализацию товаров в нашу пользу в декларациях по НДС за 1 квартал 2025 года. Это подтверждается данными из раздела 9 их деклараций.
По доводам об отсутствии ресурсов у контрагентов:
Отсутствие у партнеров собственных сотрудников, офиса или транспорта не означает, что они не могут вести бизнес. Привлечь работников можно по договорам ГПХ, аутсорсинга или аутстаффинга. Это нормальная практика.
В протоколе нет сведений о том, что налоговая провела проверку и установила фактическое отсутствие ресурсов. Ваши доводы основаны на предположениях.
По проявлению осмотрительности:
Перед заключением договоров мы проверили контрагентов:

• Подтвердили регистрацию в ЕГРЮЛ
• Убедились, что директора не дисквалифицированы
• Проверили адрес — он не массовый
• Убедились, что компании не в процессе ликвидации и не имеют задолженностей

Мы запросили уставы, анкеты контрагентов и другие документы. Условия сделок были коммерчески выгодными: цена устраивала, оплата проходила после поставки товара.
По контрагентам второго и третьего звена:
Наши партнеры не взаимозависимы с нами, не аффилированы, не подконтрольны. Никаких согласованных действий по уходу от налогов не было.
Согласно Постановлению Конституционного Суда РФ от 19.12.2019 № 41-П, мы не обязаны отвечать за действия всех участников цепочки поставок. Право на вычет НДС не зависит от того, заплатили ли налоги контрагенты наших контрагентов.
Верховный Суд РФ в определениях от 14.05.2020 № 307-ЭС19-27597 и от 28.05.2020 № 305-ЭС19-16064 указал: отказ в вычете НДС возможен только при доказанности умысла покупателя на уклонение от налогов или его осведомленности о нарушениях партнера.
Вывод:
Мы выбрали контрагентов в соответствии с обычаями делового оборота. Сделки реальны, документы в порядке, осмотрительность проявлена. Оснований для уточнения налоговых обязательств нет.

Главное: Не идите на поводу у налоговой. Если вы уверены в своем контрагенте — отстаивайте свою позицию.
Напишите в наш телеграм бот и мы поможем вам с проверкой и подбором надежных контрагентов.